مهامها الأساسية هي التأمين المجال الجوي الوطني في كل الظروف وتأمين الترابط ونقل الأفراد والمعدات كما يمكنها إنزال الأفراد والعتاد المبرمج من طرف الأركان الوطنية،كما تقوم المديرية بالموازاة مع هذه المهام بالمشاركة في التنمية الوطنية عن طريق الرقابة البحرية ومكافحة الطيور والجراد، بالإضافة إلى البذر الجوي،وعلى الصعيد الإنساني،الإخلاء الصحي والإنقاذ.
تتوفر المديرية على مدرسة عسكرية للطيران أنشئت مؤخرا في أطار لتكوين الطيارين والميكانيكيين بإمكانها أن تقدم للجيش طواقم مؤهلة.